妖怪やアイテムを合成して、新たな妖怪を生み出すことができる。
日本では第4章クエスト「ドキドキ合成チャレンジ」後に団々坂の「正天寺」で妖怪合成が可能になる。
USAでは第4章クエスト「私を合成に連れてって」後にイーストカシュー地区の「教会」で妖怪合成が可能になる。
一度合成した妖怪は元に戻せないのでよく考えてから合成しよう。
| No | 1つめ | 2つめ | 結果 |
| 1 | ドキ土器 | 火焔土器 | 怒気ドキ土器 |
| 2 | |||
| 3 | かたのり小僧 | 親方ダンベル | かたのり親方 |
| 4 | しょうブシ | 名刀マサムネ | まさむね |
| 5 | しょうブシ | 妖刀ムラマサ | むらまさ |
| 6 | しょうブシ | 真剣くさなぎ | くさなぎ |
| 7 | 砂ン丘入道 | 砂丘の砂 | ノー砂ン丘入道 |
| 8 | ダソックス | ナガバナ | アーダコンダ |
| 9 | にんぎょ | 人魚の宝玉 | 八尾比丘尼 |
| 10 | |||
| 11 | |||
| 12 | あっそう山 | ハニワ | あそっ火山 |
| 13 | おこ武者 | 暴虐な刀 | くしゃ武者 |
| 14 | さむガリ | 雪王のマント | ガリ王子 |
| 15 | ヒキコウモリ | かいてきクローゼット | トジコウモリ |
| 16 | 日ノ鳥S∞の欠片1 | 日ノ鳥S∞の欠片2 | 日ノ鳥ストーン∞ |
| 17 | |||
| 18 | でんぱく小僧 | ギガヘルツ玉 | でんじん |
| 19 | 風呂ずきん | アロマな入浴剤 | ふろーラル |
| 20 | |||
| 21 | |||
| 22 | ジンギスギスカン | 木彫りのクマ | チンギスギスハン |
| 23 | 砂夫 | 砂スーツ | 大山砂夫 |
| 24 | |||
| 25 | ムリカベ | みかげ石 | むりだ城 |
| 26 | ムリカベ | メリケン粉 | ウォール・ガイ |
| 27 | あかなめ | 怪魔素素 | あかなめ・怪 |
| 28 | あかなめ | MVPのトロフィー | 総ナメ |
| 29 | ダイナシー | 太古のDNA | Ｄ−レックス |
| 30 | Sストーン∞の欠片1 | Sストーン∞の欠片2 | Sストーン∞ |
| 31 | ロボニャン | メリケン粉 | ロボニャンUSA |
| 32 | おもいだスッポン | 記憶吸い取り機 | おもいだ神 |
| 33 | ナンデナン | 大山砂夫 | そーナンだー |
| 34 | しゃれこ婦人 | モテモ天 | カラカラさん |
| 35 | キュン太郎 | 愛のシャク | ズキュキュン太 |
| 36 | キズナメコ | キュン太郎 | キズナース |
| 37 | 迷い車 | くろがねセンボン | だっせんしゃ |
| 38 | |||
| 39 | |||
| 40 | |||
| 41 | |||
| 42 | |||
| 43 | |||
| 44 | |||
| 45 | ざしきわらし | 怪魔の素 | ざしきわらし・怪 |
| 46 | |||
| 47 | |||
| 48 | |||
| 49 | |||
| 50 | しわくちゃん | 生命のおしろい | 老いらん |
| 51 | |||
| 52 | |||
| 53 | |||
| 54 | |||
| 55 | |||
| 56 | |||
| 57 | |||
| 58 | |||
| 59 | |||
| 60 | |||
| 61 | |||
| 62 | |||
| 63 | |||
| 64 | |||
| 65 | カンペちゃん | からみぞん | 無茶ぶりっ子 |
| 66 | |||
| 67 | |||
| 68 | |||
| 69 | |||
| 70 | |||
| 71 | |||
| 72 | |||
| 73 | |||
| 74 | |||
| 75 | |||
| 76 | |||
| 77 | |||
| 78 | |||
| ジバニャン | イガイガグリ | トゲニャン | |
| メラメライオン | |||
| だるだるま | |||
| ダイナシー | |||
| ナンデナン | 大山砂男 | そーナンだー | |
| しょうブシ | 名刀マサムネ | まさむね | |
| しょうブシ | 妖刀ムラマサ | むらまさ | |
| しょうブシ | 神剣クサナギ | くさなぎ | |
| クワノ武士 | 大将の魂 | クワガ大将 | |
| モテモ天 | モテウェポン | モテマクール | |
| でんぱく小僧 | ギガヘルツ玉 | でんじん | |
| 武者かぶと | 無双の魂 | かぶと無双 | |
| キンカク | プラチナインゴット | プラチナカク | |
| さむガリ | 雪王のマント | ガリ王子 | |
| キュン太郎 | 愛のシャク | ズキュキュン太 | |
| ゆきおんな | 白銀のかみどめ | ふぶき姫 | |
| かたのり小僧 | 親方ダンベル | かたのり親方 | |
| デビビル | 邪心のかたまり | デビビラン | |
| しわくちゃん | 生命のおしろい | 老いらん | |
| りゅーくん | 龍神玉 | 龍神 | |
| おこ武者 | 暴虐な刀 | くしゃ武者 | |
| 砂夫 | 砂スーツ | 大山砂夫 | |
| くだん | 神通力水 | 大くだん | |
| 花子さん | 呪いの日記帳 | 呪野花子 | |
| おともらし | 爆音クラクション | 爆音ならし | |
| おもいだスッポン | 記憶吸い取り機 | おもいだ神 | |
| にんぎょ | 人魚の宝玉 | 八百比丘尼 | |
| ひも爺 | 愛情おむすび | くいい爺 | |
| ジンギスギスカン | 木彫のクマ | チンギスギスハン | |
| 寝ブタ | 金魚のちょうちん | ねぶた | |
| 江戸っ子パンダ | 匠のちょうちん | 大江戸忍者パンダ | |
| ひつま武士 | 金のしゃちほこ | ひまつ武士 | |
| たこやっ鬼 | たこ焼き器 | たこや鬼神 | |
| 砂ン丘入道 | 砂丘の砂 | ノー砂シ丘入道 | |
| すもうどん | 伝統のあみ傘 | 横綱うどん | |
| あっそう山 | ハニワ | あそっ火山 | |
| ウキウキビ | 真っ赤なハイビスカス | トキメキビ | |
| もんげ〜ヒトダマ | |||
| ムリカベ | みかげ石 | むりだ城 | |
| ヒキコウモリ | かいてきクローゼット | トジコウモリ | |
| なまはげ | なまだま | なまなまはげ | |
| アンビリバ坊 | バッドボール | バッド坊や | |
| 風呂ずきん | アロマな入溶剤 | ふろーラル | |
| まてんし | 発売延期の書状 | 魔天王 | |
| ダイナシー | 太古のDNA | D-レックス | |
| あかなめ | MVPのトロフィー | 総なめ | |
| えんらえんら | 怪魔の素 | えんらえんら・怪 | |
| 河童 | 怪魔の素 | 河童・怪 | |
| ろくろ首 | 怪魔の素 | ろくろ首・怪 | |
| あかなめ | 怪魔の素 | あかなめ・怪 | |
| 泥田坊 | 怪魔の素 | 泥田坊・怪 | |
| から傘お化け | 怪魔の素 | から傘お化け・怪 | |
| くだん | 怪魔の素 | くだん・怪 | |
| けうけげん | 怪魔の素 | けうけげん・怪 | |
| にんぎょ | 怪魔の素 | にんぎょ・怪 | |
| ナガバナナ | メリケン粉 | チョコバナーナ | |
| ナンデナン | 大山砂夫 | そーナンだー |
妖怪ウォッチバスターズ参考例
| No | 1つめ | 2つめ | 結果 |
| 1 | カブトさん | ヨロイさん | ゲンマ将軍 |
| 2 | だるだるま | ちからモチ | だるまっちょ |
| 3 | しゃれこ婦人 | モテモ天 | カラカラさん |
| 4 | ドウカク | ドウカク | ギンカク |
| 5 | ギンカク | ギンカク | キンカク |
| 6 | ぜっこう蝶 | ゼッコウ蝶 | サイコウ蝶 |
| 7 | ホノボーノ | ドンヨリーヌ | ヒョウヘンヌ |
| 8 | から傘お化け | ふじのやま | から傘魔人 |
| 9 | モレゾウ | プルファント | ガマンモス |
| 10 | うらや飯 | じがじいさん | プライ丼 |
| 11 | 迷い車 | くろがねセンボン | だっせんしゃ |
| 12 | キズナメコ | キュン太郎 | キズナース |
| 13 | ＴＥＴＳＵＹＡ | ネクラマテング | ＫＡＮＴＥＴＳＵ |
| 14 | 草くいおとこ | メラメライオン | 肉くいおとこ |
| 15 | うんがい鏡 | さとりちゃん | うんがい三面鏡 |
| 16 | しょうぶし | 名刀マサムネ | まさむね |
| 17 | しょうブシ | 妖刀ムラマサ | むらまさ |
| 18 | しょうぶし | 神剣くさなぎ | くさなぎ |
| 19 | クワノ武士 | 大将の魂 | クワガ大将 |
| 20 | モテモ天 | モテウェポン | モテマクール |
| 21 | でんぱく小僧 | ギガヘルツ玉 | でんじん |
| 22 | ゆきおんな | 白銀のかみどめ | ふぶき姫 |
| 23 | 武者かぶと | 無双の魂 | かぶと無双 |
| 24 | キンカク | プラチナインゴッド | プラチナカク |
| 25 | さむガリ | 雪王のマント | ガリ王子 |
| 26 | キュン太郎 | 愛のシャク | ズキュキュン太 |
| 27 | かたのり小僧 | 親方ダンベル | かたのり親方 |
| 28 | しわくちゃん | 生命のおしろい | 老いらん |
| 29 | デビビル | 邪心のかたまり | デビビラン |
| 30 | りゅーくん | 龍神玉 | 龍神 |
| 31 | おこ武者 | 暴虐な刀 | くしゃ武者 |
| 32 | 砂夫 | 砂スーツ | 大山砂夫 |
| 33 | くだん | 神通力水 | 大くだん |
| 34 | 花子さん | 呪いの日記帳 | 呪野花子 |
| 35 | おともらし | 爆音クラクション | 爆音ならし |
| 36 | おもいだスッポン | 記憶吸い取り機 | おもいだ神 |
| 37 | にんぎょ | 人魚の宝玉 | 八百比丘尼 |
| 38 | ひも爺 | 愛情おむすび | くいい爺 |
| 39 | ジンギスギスカン | 木彫りのクマ | チンギスギスハン |
| 40 | 寝ブタ | 金魚のちょうちん | ねぶた |
| 41 | 江戸っ子パンダ | 匠のちょうちん | 大江戸忍者パンダ |
| 42 | ひつま武士 | 金のしゃちほこ | ひまつ武士 |
| 43 | たこやっ鬼 | たこ焼き器 | たこや鬼神 |
| 44 | 砂ン丘入道 | 砂丘の砂 | ノー砂ン丘入道 |
| 45 | すもうどん | 伝統の編み傘 | 横綱うどん |
| 46 | あっそう山 | ハニワ | あそっ火山 |
| 47 | ウキウキビ | 真っ赤なハイビスカス | トキメキビ |
| 48 | コマさん | もんげ〜ヒトダマ | ししコマ |
| 49 | コマじろう | もんげ〜ヒトダマ | とらじろう |
| 50 | ムリカベ | みかげ石 | むりだ城 |
| 51 | ヒキコウモリ | かいてきクローゼット | トジコウモリ |
| 52 | あかなめ | 怪魔の素 | あかなめ・怪 |
| 53 | 泥田坊 | 怪魔の素 | 泥田坊・怪 |
| 54 | えんらえんら | 怪魔の素 | えんらえんら・怪 |
| 55 | 河童 | 怪魔の素 | 河童・怪 |
| 56 | からかさお化け | 怪魔の素 | からかさお化け・怪 |
| 57 | ざしきわらし | 怪魔の素 | ざしきわらし・怪 |
| 58 | くだん | 怪魔の素 | くだん・怪 |
| 59 | けうけげん | 怪魔の素 | けうけげん・怪 |
| 60 | にんぎょ | 怪魔の素 | にんぎょ・怪 |
| 61 | ろくろ首 | 怪魔の素 | ろくろ首・怪 |