フリータイム開始時やフリーダンジョン初攻略時などで入手できます。
2周目以降は、フリータイム開始時に、それまでの周回で攻略済みのフリーダンジョンの分が加算されています。
なので、改めてフリーダンジョンを攻略しても新たにカケラを入手することはありません。
また、引き継ぎ特典で「縁のカケラMAX」を選んだ場合は、フリータイム開始時の縁のカケラが最大になります。
（※未攻略のフリーダンジョン・イベントで入手するものは除く）
| 入手時期 | 個数 | MAX | |
| 第2話 4/27 | 学園から出た後 | 2 | 3 |
| 第3話 5/7 | フリータイム開始時 | 2 | 3 |
| 翠の小迷宮初攻略時 | +1 | ||
| 第七霊子結界初攻略時（2周目以降） | +1 | ||
| 第4話 5/21 | フリータイム開始時 | 1 | 2 |
| 追憶の遺跡初攻略時 | +1 | ||
| 星霜の霊域初攻略時（2周目以降） | +1 | ||
| 学園外のクエストのどちらかを達成後 | +1 | ||
| 第5話 6/3 | フリータイム開始時 | 2 | 4 |
| 水鏡の庭園初攻略時 | +1 | ||
| 赫奕の要塞初攻略時（2周目以降） | +1 | ||
| 幕間 6/13 | フリータイム開始時 | 2 | 5 |
| 祠前の地面の光を調べる | +1 | ||
| 第6話 6/26 | フリータイム開始時 | 3 | 5 |
| 天空の回廊初攻略時 | +1 | ||
| 水底の冥獄初攻略時（2周目以降） | +1 | ||
| 黄昏の僧院攻略後 | +1 | ||
| 第7話 7/7 | フリータイム開始時 | 4 | 6 |
| 金闇なる廃墟初攻略時 | +1 | ||
| 最果の僧院初攻略時（2周目以降） | +1 | ||