第4話で1Fエントランスでふぶきちゃんと会話すると「音楽」アプリを入手でき、
音楽を再生する事ができます。
♪に数字が書いてあるものはミュージックカードがその数の分解放に必要になります。
ミュージックカードはストーリーミッションのお宝ドロップのハズレでやあかねこ/しろいぬ通販で入手できます。
なお、バージョン限定の音楽もあります。
| No | 名称 | ♪ | 使用場所 |
| 1 | バスターズ アジト | − | バスターズハウス |
| 2 | 通常ミッション | − | ミッション |
| 3 | パトロールミッション | 2 | パトロール さくら中央シティをパトロールせよ！ がんばれ！ケマモン隊長！ |
| 4 | 隠密・インポッシブル | 2 | 最終決戦！バスターズよ永遠に！ 第2次スーパーロボニャン大戦 |
| 5 | フシギな妖怪登場 | 1 | YBKホール イベント |
| 6 | 探索-妖怪をさがせ | 1 | 最恐！怪魔五人衆！ |
| 7 | 無限地獄 | 1 | イベント |
| 8 | のんびりした場所 | 1 | イベント |
| 9 | にぎやかな店内 | 1 | イベント |
| 10 | ケマモト駅 | 1 | イベント |
| 11 | 平釜平原の大合戦 | 1 | 合戦！元祖軍大将を狙え！ 合戦！本家軍大将を討て！ |
| 12 | 福福超特急 | 1 | 発見！ツチノコ捜索隊！ |
赤字：赤猫団限定 青字：白犬隊限定
| No | 名称 | ♪ | 使用場所 |
| 1 | VSウィスマロマン | 3 | 最終決戦！バスターズよ永遠に！など |
| 2 | VS 赤魔寝鬼 白古魔 | 3 | 獅子奮迅！白の魔将！！ 千客万来！赤の魔将！など |
| 3 | ミッションクリア | 2 | ミッションクリア時 |
| 4 | 勝利！！-バスターズ- | 2 | クリア画面 |
| 5 | 敗北・・・ | 1 | 失敗画面 |
| 6 | 鬼時間-逃走中 | 1 | ビックボス発見時 |
| 7 | 鬼時間-忍び足 | 1 | ビックボスミッション |
| 8 | 事件発生！！ | 1 | 災厄を封印せよ！ 運命の糸をつむぐものなど |
| 9 | 戦闘！！ | 1 | ミニミニミッション |
| 10 | vs 妖怪-2- | 1 | 第2次スーパーロボニャン大戦など |
| 11 | vs へんな妖怪 | 1 | 熱湯！熱闘！さくらの湯！ 地獄の熱湯！おのぼり黒トン！など |
| 12 | vs つよい妖怪 | 1 | さまざまなボスマップ |
| 13 | vs 和風な妖怪 | 1 | コマじろう救出大作戦！など |
| 14 | vs トキヲ・ウバウネ | 2 | トキヲかけるババア（リメイク版）など |
| 15 | vs スベテ・ウバウネ | 2 | トキヲかけるババア（リメイク版）など |
| 14 | 魔界議長 イカカモネ・ソウカモネ | 2 | イカカモネ・ソウカモネなど |
| 15 | ラストバトル-覚悟は いイカ！！！ | 2 | イカカモネ・ソウカモネなど |
| 16 | 北斗の犬のテーマ | 2 | めざせ月兎組！紅白ボス合戦！ |
| 17 | VSキャプテンサンダー | 2 | 月に囚われた妖怪など |
| 18 | USAピョンベイダーモード | 2 | 月に囚われた妖怪など |
| 19 | 進撃！ウィスパゲリオン！ | 2 | 第3次スーパーロボニャン大戦など |
| 20 | vs ぬらりひょん | 2 | 妖魔を総べるものなど |
| 21 | vs ぬらねいら | 2 | 妖魔を総べるものなど |
| No | 名称 | ♪ | 使用場所 |
| 1 | 妖怪ウォッチ バスターズのテーマ | − | タイトル画面 決戦！赤鬼再来！ 五つ星の創造神 |
| 2 | なまえを決めよう！ -バスターズ- | − | 日記選択画面 メダルこうかん |
| 3 | コマさん 都会へゆく | 2 | イベント中など |
| 4 | コマさん 都会へゆく -KJ remix- | 2 | バスターズ・バトル feat. KJなど |
| 5 | 最強の妖怪 マスターニャーダ | 2 | イベント |
| 6 | 無敵王者ガッツ仮面！ | 2 | 出動！過去の世界！ |
| 7 | オロチさすらいのテーマ | 2 | 影に潜むアサシン！大蛇隊！ |
| 8 | お金ナイダ―のテーマ | 2 | オト姫さまに会うためになど |
| 9 | USAピョンのテーマ | 3 | 孤高のバスターズダニ！ |
| 10 | お笑いタイム | 2 | ちっちゃな問題とながーい話 |
| 11 | のんびりのんきな昼下がり | 1 | イベント中 |
| 12 | ブキミな妖怪登場 | 1 | イベント中 |
| 13 | キュートな妖怪登場 | 1 | イベント中 |
| 14 | 和風な妖怪登場 | 1 | イベント中 |
| 15 | 未来からの使者ロボニャン参上 | 1 | イベント中 |
| 16 | じんめん犬の大脱走 | 1 | イベント中 |
| No | 名称 | ♪ | 使用場所 |
| 1 | ドタバタ状態 | 1 | 第1話 |
| 2 | 自転車レース・ビリ・・・ | 1 | なし |
| 3 | 決心！！ | 1 | イベント中 |
| 4 | 逃げろ〜！！ | 1 | 次回予告 |
| 5 | ちっちゃないたずら | 1 | イベント中 |
| 6 | わるだくみ | 1 | イベント中 |
| 7 | かなしいおはなし | 1 | イベント中 |
| 8 | まったりタイム | 1 | イベント中 |
| 9 | めでたしめでたし！ | 1 | イベント中 |
| 10 | おとぼけなヤツら | 1 | イベント中 |
| 11 | レッツ！かくれんぼ | 1 | イベント中 |