シナリオを進めるとウッドパークにホワイトが現れて他のカラーフォンデュの救出を頼まれます。
カラーフォンデュは各エリアに1体ずつステルスボックスの中におり、
リアクターを使って見つけ出して救出します。
救出するとウッドパークでアイテム交換、アイテム購入、ペイント配合が可能になります。
| カラーフォンデュ | エリア | 場所 |
| グリーン | 崩落都市 | 送電施設の南西部の隠し部屋(南側から行ける) |
| ブラック | 歓楽の霊道 | 動装置の西にある島の南側の洞くつ |
| ブルー | 凍骨の氷原 | 鉄の箱舟から北西の水中を抜けた洞窟 |
| イエロー | 黒鉄の監獄塔 | 屋上から出て外観4階の階段下 |
| レッド | 焦熱の火山 | 山頂のルーラポイントから東南東にある高台 |
救出後にウッドパークで各カラーフォンデュと会話するとアイテム交換が出来ます。
| カラーフォンデュ | 渡すアイテム | 貰えるアイテム |
| グリーン | 緑の宝石×4 | ドラゴンの皮 |
| ブルー | 青の宝石×4 | ひかりの石 |
| イエロー | 黄色の宝石×4 | げんませき |
| レッド | 赤の宝石×4 | まじゅうの皮 |
救出後にウッドパークでブラックと会話するとアイテム購入が出来ます。
| 名称 | 価格 |
| バイシオロン | 1800 |
| ダウンオルル | 1800 |
| スクルティオ | 1800 |
| ルカナジウム | 1800 |
| ピオリメイト | 1800 |
| ボミオッシュ | 1800 |
| インテライザー | 1800 |
| マフールーム | 1800 |
全てのカラーフォンデュを救出後にウッドパークのホワイトに報告し、センタービルのエースと会話するとペイント配合が可能になります。
配合でペイント配合を選択すると、カラーフォンデュを消費してモンスターの色を変化させることができます。
色替えをしたモンスターはアイコンの右上に色違いマークが付きます。
体と武器など複数の箇所を色替えできるモンスターは、複数のカラーフォンデュを使うことでそれぞれ色を変えることができます。
また、カラーフォンデュ同士をペイント配合すると色を混ぜることができます。
カラーフォンデュは、時空の裂け目でまれに出現するものをスカウトしたり、闘技場の勝ち抜きバトルやちいさなメダルの景品で入手することができます。
また色替えをしたモンスターを通常の配合で違う種族にすると、そのモンスターに使われていた色のカラーフォンデュが一匹だけ戻ってきます。
(複数の部位を色替えしていた場合、ランダムで１ヶ所だけ)
これは突然変異のモンスターにも当てはまるので、同じ色のカラーフォンデュを大量に確保したいときは突然変異を狙うとよいでしょう。