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最初は尾道仁涯町からメインミッションは始まりますが、「六狂人・内藤哲也！」クリア後は神室町が舞台となります。
メインミッションやサブミッションの中盤までは、正直ゴリ押しでなんとかなるでしょう。しかし亜門登場後、急激に難易度が上がり攻略が難しくなります。(戦略がないとレベル80台を揃えても勝てないアップ動画を見たことがあります。)
おすすめはポケサーファイター、侍、棚橋弘至は必須であと3人は火力の高い人で組んでください。(私はオカダ、亜門、中越レベル50中盤で立ち向かいました。ポケサーファイターと侍はスキル要員なので正直レベル必要かわかりませんが、ある程度あげると壁にはなってくれます。)
開幕から侍を召喚、スキル発動でコスト半減し全組長を召喚します。ポケサーファイターでコスト70アップさせます。(できれば亜門スキルも発動)
重要なのは、棚橋の立ち回り方です。棚橋もレベル50台でアタッカーの役目もありますが、スキル「愛の戦士」を他の5人が全滅した際に使用し、再出撃させます。棚橋が死んでしまうと、タイムオーバーの危険性も十分にあるので全滅しかけたら棚橋の位置を後方に下げて様子をみてください。
上記を3-4回戦闘で繰り返す事になると思いますが、コツさえ掴めばうまくクリアできるはずです。
| 名称 | ★ | ｴﾘｱ数 | 勝利条件 | 制限時間 | 敵人数 | 備考 | 発生条件 |
| サチコを救え！ | 1 | 1 | 敵を全滅 | 5：00 | 20人 | 5章シナリオ進行 | |
| JUSTISとの戦い | 2 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 22人 | 「サチコを救え！」後 | |
| 襲来！ 矢野軍団！ | 2 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 21人 | ヒデノリ加入 | 「JUSTISとの戦い」後 |
| 矢野軍団、総攻撃！ | 2 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 24人 | 「襲来！ 矢野軍団！」後 | |
| 六狂人・矢野通！ | 3 | 2 | 矢野を倒す | 4：00 | 20人 21人 | 矢野通戦 矢野通加入 吉川加入 | 「矢野軍団、総攻撃！」後 |
| 内藤の右腕たち | 3 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 20人 | 「六狂人・矢野通！」後 | |
| 内藤哲也、始動 | 3 | 2 | 内藤を倒す | 3：30 | 16人 26人 | 「内藤の右腕たち」後 | |
| 六狂人・内藤哲也！ | 4 | 1 | 内藤を倒す | 3：00 | 32人 | 内藤哲也戦 内藤哲也加入 | 「内藤哲也、始動」後 |
| 名称 | ★ | ｴﾘｱ数 | 勝利条件 | 制限時間 | 人数 | 備考 | 発生条件 |
| JUSTISの刺客達を倒せ！1 | 1 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 22人 | パーシー加入 | 「サチコを救え！」後 |
| JUSTISの刺客達を倒せ！2 | 2 | 1 | 敵を全滅 | 3：00 | 21人 | 「JUSTISの刺客達を倒せ！1」後 | |
| JUSTISの刺客達を倒せ！3 | 3 | 2 | 敵を全滅 | 3：30 | 15人 27人 | オオヤ加入 | 「JUSTISの刺客達を倒せ！2」後 |
| 矢野軍団の残党を倒せ！ | 4 | 2 | 敵を全滅 | 3：30 | 10人 30人 | 「六狂人・矢野通！」後 | |
| 内藤軍団の残党を倒せ！ | 5 | 3 | 敵を全滅 | 4：00 | 20人 20人 21人 | 金丸加入 | 「六狂人・内藤哲也！」後 |
| 亜門軍団を倒せ！尾道編1 | 6 | 2 | 敵を全滅 | 4：00 | 40人 25人 | 「桐生会最後の戦い」後 | |
| 亜門軍団を倒せ！尾道編2 | 7 | 2 | 敵を全滅 | 4：00 | 20人 31人 | 「亜門軍団を倒せ！尾道編1」後 | |
| 亜門軍団を倒せ！尾道編3 | 8 | 3 | 敵を全滅 | 4：30 | 6人 6人 6人 | 「亜門軍団を倒せ！尾道編2」後 |
| 名称 | ★ | ｴﾘｱ数 | 勝利条件 | 制限時間 | 人数 | 備考 | 発生条件 |
| 天山との戦い | 3 | 2 | 天山を倒す | 3：30 | 20人 22人 | 7章開始 | |
| 小島との戦い | 3 | 2 | 小島を倒す | 3：30 | 15人 20人 | 「天山との戦い」後 | |
| 恐怖のテンコジタッグ | 4 | 2 | 天山と小島を倒す | 4：00 | 30人 14人 | 天山・小島戦 天山広吉加入 小島聡加入 | 「小島との戦い」後 |
| 棚橋の刺客 | 4 | 2 | 敵を全滅 | 3：00 | 16人 32人 | 「恐怖のテンコジタッグ」後 | |
| 棚橋の攻勢 | 4 | 2 | 棚橋を倒す | 3：30 | 16人 27人 | 「棚橋の刺客」後 | |
| 決戦！ 棚橋弘至！ | 5 | 1 | 棚橋を倒す | 3：40 | 66人 | 棚橋弘至戦 棚橋弘至加入 | 「棚橋の攻勢」後 |
| 神室町に雨が降る日 | 6 | 2 | オカダを倒す | 3：50 | 30人 53人 | オカダ戦 オカダ加入 | 「決戦！ 棚橋弘至！」後 |
| 桐生会最後の戦い | 7 | 3 | 殺月を倒す | 4：20 | 36人 33人 39人 | 殺月戦 | 「神室町に雨が降る日」後 |
| 名称 | ★ | ｴﾘｱ数 | 勝利条件 | 制限時間 | 人数 | 備考 | 発生条件 |
| JUSTISの刺客達を倒せ！1 | 1 | 1 | 敵を全滅 | 2：30 | 15人 | 河田加入 | 7章開始 |
| JUSTISの刺客達を倒せ！2 | 2 | 1 | 敵を全滅 | 2：30 | 16人 | 「JUSTISの刺客達を倒せ！1」後 | |
| JUSTISの刺客達を倒せ！3 | 3 | 2 | 敵を全滅 | 3：00 | 21人 23人 | イイブチ加入 | 「JUSTISの刺客達を倒せ！2」後 |
| テンコジ軍団の残党を倒せ！ | 4 | 2 | 敵を全滅 | 3：00 | 22人 15人 | 「恐怖のテンコジタッグ」後 | |
| 棚橋軍団の残党を倒せ！ | 5 | 2 | 敵を全滅 | 3：00 | 25人 32人 | 中越加入 | 「決戦！ 棚橋弘至！」後 |
| 亜門軍団を倒せ！神室町編1 | 6 | 2 | 敵を全滅 | 4：00 | 43人 24人 | 「桐生会最後の戦い」後 | |
| 亜門軍団を倒せ！神室町編2 | 7 | 2 | 敵を全滅 | 4：00 | 22人 37人 | 「亜門軍団を倒せ！神室町編1」後 | |
| 亜門軍団を倒せ！神室町編3 | 8 | 1 | 敵を全滅 | 3：30 | 76人 | 「亜門軍団を倒せ！神室町編2」後 |
ミッションクリア後の報酬は難易度(★)により変わります。
| ★ | 組長経験値 | 経験値 | 報酬 | ||||
| 1 | 1500 | 58 | 71 | 3万円 | |||
| 2 | 2250 | 64 | 78 | 5万円 | |||
| 3 | 3000 | 70 | 85 | 7万円 | |||
| 4 | 3750 | 76 | 92 | 9万円 | |||
| 5 | 4500 | 82 | 99 | 11万円 | |||
| 6 | 6000 | 88 | 106 | 13万円 | |||
| 7 | 7500 | 94 | 113 | 15万円 | |||
| 8 | 9000 | 100 | 120 | 20万円 | |||