金闇なる廃墟初回攻略にて
顔デカのザコ敵（名前忘れました）が３体出現するエリアで壁際にてユウキの剛撃スキルをジャンプ中に出したら操作キャラ（ユウキ）が画面外に出てしまい進行できなくなるバグが起きました。
天空の回廊初回攻略にて
入口のレリックで装備を整えたあと、メニューを閉じたら操作キャラ(ミツキ)が回転する回廊の外にワープし進行不能になるバグが起きました。
パッチをあてていると全てのステージでSランクを取っていてもトロフィーは取得できない...らしい
Ver1.02で修正済み
レベルを引継ぎせずにインフィニティモードでゲームを開始すると途中加入者のレベルまで+50されている
クラブハウス右側の出口から外へ出れるが、昇降口前でイベントが発生していて外へ出られなくなってる時も実は出れる。
ただし、出ても移動不能なAREA SELECT画面に移動するだけなので、実際に外へ出て移動できる事はないです。
慌てず騒がず×ボタンで抜けるか、L、Rボタンを押しましょう。
最終話のクリアデータをロードしてラストバトル直前から再開すると、ワープの選択肢が「スタート地点」と「ゴール地点」のみになる。
（本来は「パンドラ・入口」「最終回廊・入口」「最終回廊・最奥」の3ヶ所に移動可能。Ver1.04で確認）
条件不明 キャラはゴロウ
壁際で戦闘していたら壁の外に出てしまいました。
壁に張り付いて遠距離攻撃で敵を倒しきればマップ内に戻れます。
最終話・却の柱にてミツキ・リオン合流時でソラの会話中にフリーズしました。ちなみに最新パッチ適用（2017.06.16）
なので戦闘に入る前にセーブをお勧めします。