赤猫団と白犬隊ではそのバージョンでしか仲間にならない限定妖怪が存在する。
限定妖怪はそれぞれ約50体。
(妖怪ウォッチバスターズ赤猫団/白犬隊の公式サイトにジャンプします)
バージョンごとに登場する一部のビッグボスが異なる。
異なるバージョンを持っている友達とプレイすると、
そのバージョンのボスとも戦える。
赤猫団限定ビッグボス
白犬隊限定ビッグボス
TVアニメのオープニングテーマ曲「ゲラゲラポーのうた」などででおなじみの「キング・クリームソーダ」が歌い上げる、
オープニングテーマ曲が異なる。
赤猫団オープニングテーマ曲
白犬隊オープニングテーマ曲
ミッションの通信プレイで赤猫団と白犬隊のそれぞれの参加人数によって、
得られる報酬が変わる。
赤猫団と白犬隊で特典が異なる。
記章で買えるオーラの一部が異なる。
赤猫団 爆裂グレート化オーラ
友達確定オーラ
白犬隊 存在感なさすぎオーラ
大当たり確定オーラ
片方しかプレイしていないと、初耳かも。