ウォーターガン（武器）は全部で10種類あり、それぞれに射程距離や威力などが設定されている。
武器にはレベルがあり、初期はレベル1になっている。
武器のレベルを上げることで威力が上昇するとともに見た目が変化していく。
味方として一緒に戦うCPUキャラクターが装備する武器にも武器のレベルが適用される。
| 武器レベル | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 総計 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 必要経験値 | − | 7 | 14 | 28 | 56 | 84 | 126 | 189 | 227 | 272 | 1003 |
使用する武器によってジャンプボタンを長押ししたときのウォータージャンプの性能が異なる。
使用する武器によってダッシュボタンを長押ししたときのウォーターダッシュの速度が異なる。
ツインハンドガンが最も速く、ガトリングガンが最も遅い。
| 武器名称 | 射程距離 | 水消費量 | 威力 | 精度 | 連射レート | ウォータージャンプ性能 |
| アサルトライフル | 35M | 28 | Lv1：6 MAX：15 | 98 | 10.0 | ウォーターブースト |
| ショットガン | 15M | 250 | Lv1：4 MAX：13 | 85 | 1.5 | ウォーターブースト |
| グレネードランチャー | 22M | 250 | Lv1：40 MAX：130 | 100 | 1.2 | ロケットジャンプ（落下速度低下） |
| ロケットランチャー | 50M | 300 | Lv1：40 MAX：130 | 100 | 0.6 | ロケットジャンプ（落下速度低下） |
| スナイパーライフル | 75M | 600 | Lv1：80 MAX：260 | 100 | 0.8 | ロケットジャンプ（高度維持） |
| シングルハンドガン | 50M | 110 | Lv1：15 MAX：46 | 99 | 3.0 | ダッシュジャンプ |
| ツインハンドガン | 25M | 40 | Lv1：5 MAX：15 | 98 | 30.0 | ダッシュジャンプ |
| スプレーガン | 6M | 10 | Lv1：4 MAX：13 | 100 | 20.0 | ダッシュジャンプ |
| ガトリングガン | 75M | 10 | Lv1：6 MAX：19 | 99 | 50.0 | ウォーターブースト |
| シャワーガン | 35M | 30 | Lv1：8 MAX：26 | 98 | 20.0 | ロケットジャンプ（高度維持） |
※表の射撃性能値は射撃モード１の時のもの
DLCの武器は見た目が変化するだけで性能は変わらない。
DLC武器として「和食武器シリーズ」と「和風武器シリーズ」が用意されている。
にゅうにゅうスペシャルDLCセットに含まれている、ふとまきバズーカも性能は変わらない。