ミッション中に3回ゲームオーバーになると、救済処置としてチキンキャップが使用可能になります。
初回は説明画面でON/OFFの選択、次回からはポーズメニューのOPTIONで設定可能です。
チキンキャップを使用すると、敵に発見されても3回までは見逃して貰えますが、大事なイベントシーンは…
また、スカルズ戦ではカウンターCQCの入力判定が緩和される効果もあります。(こちらは回数制限無し)
※ミッションクリア時のランクはA以下に制限されます。
更にチキンキャップを被った状態で5回ゲームオーバーになると、更なる救済処置としてひよっこキャップが使用可能になります。
ひよっこキャップは敵に一切発見されず、殴っても触れても絶対に気付かれなくなります。（但し、ボス戦は無効）
※ミッションクリア時のスコアは0になります。
ちなみにチキンキャップ/ひよっこキャップは、フリーミッションおよびSIDE OPSでも使用可能です。
その場合はメインミッションと違ってランクやスコアといった制限がノーリスクになるのが魅力ですが、
効果範囲は決まっており、一定のエリア内から移動すれば自動的に解除されます。
装備品や支援ヘリ等は全て出撃のたびに使用コストが掛かります。
常に最高グレードの装備ばかり使っていると、あっという間にGMPとリソースが尽きてしまうことでしょう。
ミッション出撃の際は、使用コストに注意してなるべく節約を心掛けよう。
特にGMPの消費が洒落にならないのが支援ヘリです。
ミッションの出撃時はもちろん、支援ヘリを呼ぶ時も撃墜された時も全てにGMPが消費されます。
くれぐれも支援ヘリのカスタマイズには注意しよう。
使用頻度の低い装備は外すかグレードを下げておくことをお勧めします。
特に麻酔系は、薬効植物のゴールデンクレセントやジギタリスを必要とするので要注意です。
資源ではプレシャスメタル、薬効植物ではハオマとジキタリス（ルテア）が希少なので、これらの消費がなるべく少ない編成を心掛けるべきです。
また、同じ武器を使用し続けると、その武器の練度が上がって使用コストが低減されます。
| GMP | 資源 | 薬効植物 | 銃座/車両 | 寄生虫 | |
| オフライン | 500万 | 50万 | 6000 | 20万 | 3000 |
|---|---|---|---|---|---|
| オンライン | 2500万 | 100万 | 3万 | 50万 | - |
※アップデートVer1.04より
保有量がサーバー管理にも対応し、セーブデータ内(オフライン)/サーバー(オンライン)の同時枠になりました。
最大保有量はオフ＋オンの合計値となります。
上限以上は回収しても無駄になってしまいますが、派遣ミッションの報酬だけは受け取れず保留扱いとなります。
なおミッション等を行うと、オフラインリソースの一定量は自動的にオン側に流れていき、オフ=1割：オン=9割に収まります。
逆に開発・使用コストなどでオフラインリソースが赤字になっても、オンラインリソースから1割が自動的に補充されます。
但しオフラインモードにすると、オンラインリソースは利用できなくなるので注意しよう。
ある程度ストーリーを進めると、こちらの行動パターンにより敵兵の装備が強化されるようになります。
派遣ミッションを成功させることで、強化装備を一時的に削ぐこともできます。
| 名称 | 効果 | 対処法 |
| ガスマスク | ガス煙幕系を無効化 | ヘッドショットまたは胴体に麻酔弾を撃つ。 |
| ヘルメット | 頭部を防御 | 殺傷武器やCQC打撃で剥ぐことが可能 はみ出ている顔の部分はヘッドショット可能 |
| 監視カメラ | 拠点基地などに配備 | 破壊可能だが、警戒態勢になる 電源設備を切れば機能停止する |
| デコイ | 兵士に擬態 | よく見れば偽物と分かる他、双眼鏡でマーキング可能 |
| 指向性地雷 | 敵拠点の潜入ルートに設置され、 踏むと爆発音で警戒態勢になる ※稀に敵が誤爆する | 赤いレーザーの後方から回収可能 D-Dogによる感知可能 |
| 暗視ゴーグル | 夜間/悪天候/煙幕の中での視界確保 | CQC打撃で剥ぐことが可能 |
| ショットガン | 戦闘時に脅威 | - |
| マシンガン | ||
| ボディアーマー | 胴体部を防御 | 顔と手足への攻撃有効 |
| シールド | 背中に携行し、戦闘時に前方防御 | 側面や背面からの攻撃有効 |
| ライオットスーツ | 全身防御 | CQC打撃でメットを剥ぐことが可能 ショットガンで装甲の破壊が可能 対物ライフルで装甲を貫通し、ヘッドショットも可 ガス煙幕系有効 |
| フラッシュライト | 視界確保 | 実弾を電球部分にあてる。（ガラス貫通化してる麻酔弾でも可） |
| スナイパーライフル | 遠距離索敵、狙撃 | 相手の斜線に入らないまたは狙撃しかえす。 |
| ミサイル | ロックオン射撃 | 戦闘支援のチャフ散布で無力化可能 |
また、特定のミッションでは車輌等の機械化兵器が登場します。
特に第二章のEXTREMEミッションに登場する赤い兵器は、攻撃力・防御力共に強化されているので要注意。
基本的には対物ライフルやミサイルなどの重火器類が対処に最も効果的です。
なお非効率ですが普通の武器でも破壊は可能。
| 名称 | 効果 | 対処法 |
| 戦闘ヘリ | 長距離移動し、機銃やミサイル掃射 | 対物ライフルやミサイルが最も有効 また、クワイエットのグレネード弾きなら見つからず破壊が可能 |
| 装甲車/戦車 | 機銃掃射、砲撃 | 地雷が最も有効で、停車時に側面や背面からフルトン回収が可能 |
| ウォーカーギア | 盾で前方防御し、機銃掃射 | 側面や背面から操縦者への攻撃が可能 また、背後からCQC捕縛も可 |
基本的に殺傷武器で兵士を倒した場合、リザルト画面で殺傷人数の項目にカウントされます。