・※同一周回内での条件数の達成及びコンプリートが必要（次周回以降に引き継がせての条件達成はできない）
| トロフィー | 名称 | 内容 | 備考 |
| プラチナ | 伝説の怪盗 | 全てのトロフィーを取得 | |
| ブロンズ | 色欲の城、落城 | 城パレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 虚飾の美術館、閉館 | 美術館パレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 暴食の銀行、破綻 | 銀行パレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 憤怒の金字塔、倒壊 | ピラミッドパレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 強欲の宇宙基地、壊滅 | 宇宙基地パレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 嫉妬の賭場、閉鎖 | カジノパレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 傲慢の客船、沈没 | 客船パレスクリア | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 真のトリックスター | メメントスクリア | シナリオ進行 |
| ゴールド | 新たなる旅立ち | エンディングを見た | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 怪盗団結成 | 怪盗団を結成した | シナリオ進行 |
| ブロンズ | 無慈悲な執行者 | 合体を50回行った※ | |
| ブロンズ | 再生に至る処刑 | ギロチン刑を行なった | シナリオ進行 |
| シルバー | 熱烈リスナー | フタバのナビを250種類聞いた※ | ⇒フタバのナビを参照 ・全ナビ約450種類有るうちの250種類を聴くだけで達成可能 ・メンバーをバランス良くバトルに参加させることが重要 （特に明智は在団時期が限られるので在団時は優先的にバトルに参加させること） |
| ブロンズ | 究極の一撃 | 一度の攻撃で 999ダメージオーバー | ・バトンタッチを受けた際のフォックスのスキル「死亡遊戯」 (バトンタッチ後は威力1.5倍)の使用で容易に達成可能 |
| ブロンズ | 一糸乱れぬ連携 | 総攻撃を50回決めた※ | |
| ブロンズ | 確かな見識 | WEAK100回突いた※ | |
| ブロンズ | 怪盗の本分 | 宝魔を入手した | |
| ゴールド | 更生の行く先 | 双子撃破 | ⇒隠しボスを参照 ・ノーマル(グッド)エンドを引継ぎいだ2周目以降限定出現の隠しボス |
| ブロンズ | 最高の相棒（ﾊﾟｰﾄﾅｰ） | 恋人を作った | ・一人でも特別な関係になれば達成 |
| ブロンズ | 反逆の塊 | アルセーヌを入手した | シナリオ進行 |
| シルバー | 仮面コレクター | ペルソナ登録率100％達成 | ・トロフィー『神に叛く者』の最強ペルソナを作成する必要が有るので 2周目以降ではないと達成は不可 ・宝魔や特殊合体によるペルソナ（作成前には名簿一覧には未掲載）も含む |
| ブロンズ | 優等生の仮面 | 試験で一位を取った | ⇒定期試験を参照 |
| ブロンズ | 真の協力者 | いずれかのコープをMAXにした | |
| ゴールド | 大怪盗団結成 | 全コープをMAXにした※ | |
| ブロンズ | 繋がる力 | 1行動でバトンタッチを 3回つないだ | ・攻撃可能な弱点持ちシャドウが3体以上出現していることが条件 ・包囲しても解除でバトンタッチ続行可能 |
| ブロンズ | お前の中の俺 | 会話交渉でペルソナを入手した | |
| ブロンズ | 数多の仮面 | 会話交渉で ペルソナを30体入手した※ | ・累計数なので、同一のペルソナの消滅→入手でもカウントされる |
| ブロンズ | 忍び寄るもの | 不意打ち50回成功※ | |
| シルバー | 類まれな反逆者 | 刈り取る者撃破 | ⇒刈り取るもの攻略を参照 |
| ブロンズ | ドリンクマニア | 自動販売機で買える ジュースを全て購入した※ | ・全ての自動販売機から買う必要は無く、1種類に1本のみの購入で可（全26種） ・テレビショッピングやシャドウから入手したものはカウントされない ・中盤以降に追加販売されるものがあるため、達成日は10/10が最速 |
| ブロンズ | 真の才能 | 人間パラメータを全てMAXにした | |
| ブロンズ | 双子の御指名 | 集団ギロチンを行なった | ・『集団ギロチン』は、5/18以降、ベルベットルームで剛毅コープとともに解禁 |
| ブロンズ | 数多の犠牲の上に | 絞首刑を行なった | ・『絞首刑』は、6/21以降、ベルベットルームに入ると解禁 |
| ブロンズ | 崇高な実験 | 電気椅子処刑を行なった | ・『電気椅子処刑』は、フタバ・パレスをクリアで解禁 |
| ブロンズ | 勤めを経て | 独房送りしたペルソナが スキルを習得した | ・『独房送り』は、剛毅コープランク3で解禁 |
| ブロンズ | 敏腕ネゴシエーター | 敵の脅迫から 人質を無事に救出した | ・仲間がクリティカルや弱点攻撃を受け、ダウンした際に 低確率で人質に取られることがあり、その際の救出交渉を成功させると達成 （ゲーム難易度が高い程、発生しやすい） ・ネットワーク機能の怪盗同盟を利用することでも達成できる |
| ブロンズ | 凄腕ガンマン | 一度の銃撃で3体以上の敵を 同時に撃破した | ・行動ターン内であれば、攻撃回数は問われない ・ノワールの銃撃は全体一斉攻撃タイプの為、達成しやすい （シャドウのHPをある程度削ってから銃撃でとどめを狙うか もしくはメメントス上層の低レベルシャドウを狙う） |
| ブロンズ | 駆け出し怪盗団 | ミッションを5種類クリア※ | |
| シルバー | パーフェクトな仕事 | ミッションを全てクリア※ | ・三島のチャットを読まないと発生しないものが多数有り 見忘れがちになるので、他のチャット確認時でも遡って確認すること ・12/24以降はミッションクリアができない |
| ブロンズ | 俺の庭 | 全てのスポットを開放※ | ・スポットはシナリオ進行、各コープのイベントや読書で解禁 |
| ブロンズ | 釣り堀の主 | 釣り堀のヌシを釣った | ⇒釣りを参照 ・ヌシを釣るためには最高級練り餌が必要 ・器用さランク5で釣り回数7回目のラストで出る |
| ブロンズ | アグレッシブサーチャー | パレスのサーチオブジェクトから アイテムを150個入手※ | |
| ブロンズ | 裏取引の代物 | カスタムした銃を購入した | |
| ブロンズ | クラフトワーカー | 潜入道具を 自分で全種類作成した※ | ・モルガナのコープランク6（7/25イベント）ですべての潜入道具作成が解放 ・川上貞代が代行して作成した分は含まれない |
| ブロンズ | 本の虫 | 全ての本を読了した※ | ⇒読書を参照 ・11/18以降は学校（図書館）に入れなくなる為 図書館の本は11/17迄に読破しておくこと ・「速読ノ秘術」を読むと、1度に2回分進めることができる |
| シルバー | 神に叛く者 | サタナエルを作成した | ・サタナエルは2周目以降限定作成可の最強ペルソナ （ノーマル(グッド)エンドを引継ぎいだ2周目以降で解禁） |
| ブロンズ | 黄金の指 | テレビゲームを全てクリアした※ | ⇒TVゲームを参照 ・コープイベントでプレイした分は、プレイ回数としてカウントされない |
| ブロンズ | 街の強打者 | バッティングセンターで ホームランを打った | ⇒バッティングセンターを参照 |