ナワバリバトルは4人対4人のオンライン対戦限定モード。
インクを塗り合い、塗った面積の多いチームが勝利する。
自分のチームの色のインクがついている地面が「ナワバリ」だ。
※平坦な地面や斜面など、マップを上空から見た時に確認できる地面が対象となり、壁は対象外となる。
ナワバリバトルはこのナワバリの面積を競い合う。
基本的にランダムでマッチングが行われるが、
「フレンド合流」からフレンド登録しているプレイヤーが参加しているマッチに合流することもできる。
但しフレンドが参加しているマッチに空きがなければ別のマッチで試合が始まる。
ナワバリバトルのステージはこちら
※最終フェス後、勝利ボーナスが+1000pとなりました
ナワバリバトルにおけるステージごとの総塗り面積一覧
| 順位 | ステージ名 | ポイント |
| 1 | ショッツル鉱山 | 3125P |
| 2 | デカライン高架下 | 2465P |
| 3 | キンメダイ美術館 | 2445P |
| 4 | ヒラメが丘団地 | 2375P |
| 5 | モンガラキャンプ場 | 2315P |
| 6 | アンチョビットゲームズ | 2290P |
| 7 | モズク農園 | 2125P |
| 8 | マサバ海峡大橋 | 2100P |
| 9 | アロワナモール | 2020P |
| 10 | マヒマヒリゾート＆スパ 水面降下後 | 1995p |
| 11 | シオノメ油田 | 1900P |
| 12 | ホッケふ頭 | 1855P |
| 13 | タチウオパーキング | 1760P |
| − | マヒマヒリゾート＆スパ水面降下前 | 1715P |
| 14 | ネギトロ炭鉱 | 1655P |
| 15 | ハコフグ倉庫 | 1600P |
| 16 | Bバスパーク | 1530P |